Корректно: формат 3D, 3D-кинотеатр.
3D – это сокращение от three-dimensional (трехмерный). Кириллицей его обычно не пишут. В указанных случаях сокращение выступает в роли первой части сложного слова и пишется через дефис: 3D-книга, 3D-формат, 3D-эффект.
Корректно: программное обеспечение 3D.
Верно: возможность 3D-трансформирования.
Верно дефисное написание.
Корректно: 3D-моделирование, 3D-принтер, 3D-модель, 3D-технологии.
Правильно: 3D-проектирование.
Правильно: 3D-открытка.